rgdal é obsoleto [em inglês, ‘deprecated’!
O pacote rgdal, utilizado originalmente nesta postagem com o intuito de preparar o mapa apresentado em Rodrigues et al. (2017), é considerado obsoleto atualmente e não existe mais para versões novas de R. Logo, eu removi a execução deste código aqui nesta postagem. Em breve, preparei uma atualização deste mapa usando outros pacotes alternativos.
Os scripts abaixo reproduzem o mapa publicado recentemente em Rodrigues, Perdiz, e Flores (2017). Caso você possua conta no ResearchGate, pode visualizar o trabalho neste link ou acessando esta página. O mapa principal apresenta localidades de coleta de espécimes de plantas em duas unidades de conservação do estado de Roraima. A maioria dessas coletas foram feitas durante a expedição Terra Incognita, ocorrida em dezembro de 2013, organizada pelas equipes gestoras do Parque Nacional Serra da Mocidade e Estação Ecológica de Niquiá, com financiamento da ARPA. Veja mais detalhes sobre a expedição ao fim desta postagem.
Carrega os pacotes
Para manipular os dados e gerar o mapa desta postagem, fiz uso dos pacotes abaixo:
- broom (Robinson, Hayes, e Couch 2022);
- dplyr (Wickham et al. 2021);
- GISTools (Brunsdon e Chen 2014);
- maps (Brownrigg 2021);
- rgdal (Bivand, Keitt, e Rowlingson 2021).
É imprescindível que todos estejam instalados, atualizados e com as dependências instaladas.
Além desses pacotes, também fiz uso dos pacotes blogdown (Xie, Dervieux, e Presmanes Hill 2022), rmarkdown (Xie, Allaire, e Grolemund 2018), e knitr (Xie 2021), tanto para gerar a estrutura deste sítio web quanto para gerar os arquivos .html que vocês estão lendo neste momento.
Importa os dados
Cria variáveis para os plots
Compõe um gráfico para acomodar os diferentes plots e plota cada mapa
À primeira vista, repare que a figura, por ser composta de três plots individuais, pode não parecer bem ajustada devido aos dispositivos de visualização:
Caso queira gerar um pdf com a figura acima…
Execute o código abaixo e terás, então, um pdf com a imagem acima. A mágica ocorre devido à função pdf(), inserida antes da execução da função layout.
Informações sobre esta postagem
Esta postagem foi escrita em ambiente R utilizando os pacotes R Markdown e knitr.
Divirta-se!!!
Sobre as unidades de conservação aqui citadas
O Parque Nacional (PARNA) Serra da Mocidade e a Estação Ecológica (ESEC) de Niquiá são unidades de conservação federal situadas no município de Caracaraí, no estado de Roraima, Brasil. O PARNA Serra da Mocidade possui uma área de 350.960 hectares e caracteriza-se pela ocorrência de uma serra isolada, com aproximadamente 1.800 metros de altitude, localizada no limite da unidade conservação com a área indígena Yanomami. Por outro lado, a ESEC Niquiá possui 284.787,42 hectares, apresentando na sua maior parte áreas planas, com duas elevações ente 200-500 m de altitude.
Sobre a expedição
No período de 04 a 18 de dezembro o Parque Nacional Serra da Mocidade e a Estação Ecológica Niquiá realizaram a Expedição de Pesquisa Científica Terra incognita, nomeada em alusão à Hamilton Rice, explorador americano que assim chamou a região oeste de Roraima em seu livro Exploração à Guiana Brasileira. Financiada com recursos do Programa ARPA (Áreas Protegidas da Amazônia), a expedição reuniu várias instituições (Instituto Chico Mendes de Conservação da Biodiversidade/ICMBio, Universidade Federal de Roraima/UFRR, Instituto de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Roraima/IACTI, Universidade Federal do Amazonas/UFAM, Centro de Estudos da Biodiversidade Amazônica/CENBAM/PPBio, Secretaria do Patrimônio da União/SPU e Instituto Federal de Roraima/IFRR) e pesquisadores de diversas áreas do conhecimento, que se propuseram a levantar informações sobre uma região pouco conhecida pela ciência, buscando contribuir com a elaboração dos planos de manejo das unidades, ora em execução.
Vejam este link para ter acesso a um pequeno documentário sobre algumas das descobertas dessa viagem.
Saiba mais
Para conferir o trabalho onde esse mapa foi publicado siga o link abaixo:
Para ver outros mapas produzidos da mesma maneira:
Lavor et al. 2016. Rediscovery of Pilosocereus oligolepsis (Cactaceae) in the State of Roraima, Brazil. Cactus and Succulent Journal 88(3):137-143 - Link no ResearchGate;
Barbosa et al. 2017. Decomposition rates of coarse woody debris in undisturbed Amazonian seasonally flooded and unflooded forests in the Rio Negro-Rio Branco Basin in Roraima, Brazil. Forest Ecology and Management 397(1) - Link no ResearchGate.